rapd缩写是什么意思

RAPD英文含义

1、RAPD的英文全称：relative afferent pupillary defect (ophthalmology; aka Marcus-Gunn Pupil) | 中文意思：───相对传入瞳孔缺陷（眼科；又名马库斯·冈恩瞳孔）

2、RAPD的英文全称：Randomly Amplified Polymorphic DNA | 中文意思：───随机扩增多态DNA

3、RAPD的英文全称：Randomly Amplified Polymorphism DNA | 中文意思：───随机扩增多态性DNA

4、RAPD的英文全称：relative afferent pupillary defect (ophthalmology; aka Marcus-Gunn Pupil) | 中文意思：───相对传入瞳孔缺陷(眼科；也就是上睑下垂合并的学生)

5、RAPD的英文全称：Rapid Application Protocol Driver | 中文意思：───快速应用程序协议驱动程序

6、RAPD的英文全称：Resource For Algorithm For Preprocessing The Database | 中文意思：───数据库预处理算法资源

7、RAPD的英文全称：Relative Afferent Pupillary Defect | 中文意思：───相对传入瞳孔缺陷

8、RAPD的英文全称：Random amplified polymorphic DNA | 中文意思：───随机扩增的多态性DNA

9、RAPD的英文全称：Randomly Amplified Polymorphic DNA (aka Random Amplification of Polymorphic DNA) | 中文意思：───随机扩增DNA多态性(即随机扩增多态性DNA)

标记和性状共分离什么意思

标记和性状共分离：在有性繁殖的后代,假如基因附近有一紧密连锁的分子标记,在细胞减数分裂时分子标记与基因之间由于相距太近很少有机会发生交换。

标记和性状共分离如果目的片段存在一个突变，则所有大于某一大小对应于突主变位置的双脱氧终止片段无野生型系统，对于每一个突有多次机会检测其迁移率改变，提高了检测突变的效率。

ddF方法克服了SSCP分析时因DNA长度影响SSCP显示的困难，通过一种双脱氧核昔酸生产特异性的单链DNA，使其中长度合适的DNA片段显示SSCP改变。

标记和性状共分离随机扩增多态性DNA：

它是利用随机引物（一般为8—10bp）通过PCR反应非定点扩增DNA片段，然后用凝胶电泳分析扩增产物DNA片段的多态性。扩增片段多态性便反映了基因组相应区域的DNA多态性。RAPD所使用的引物各不相同。

但对任一特定引物，它在基因组DNA序列上有其特定的结合位点，一旦基因组在这些区域发生DNA片段**人、缺失或碱基突变，就可能导致这些特定结合位点的分布发生变化，从而导致扩增产物数量和大小发生改变，表现出多态性。

就单一引物而言，其只能检测基因组特定区域DNA多态性，但利用一系列引物则可使检测区域扩大到整个基因组，因此，RAPD可用于对整个基因组DNA进行多态性检测，也可用于构建基因组指纹图谱。

请问，双假测交理论是什么能说详细点最好。

分子标记指可遗传并可检测到的DNA序列或蛋白质。蛋白质标记主要是指同工酶、等位酶、贮藏蛋白等等，本文主要介绍DNA标记。理想的分子标记应具有以下几个条件：①以孟德尔方式遗传。②多态性好，自然条件下存在许多变异位点。③遍布整个基因组，能够检测到整个基因组的变异。④共显性遗传，即可以区别纯合体和杂合体。⑤表现“中性”，即不影响目标性状的表达。⑥重复性好，便于资源共享。⑦自动化程度高。近年来，关于分子标记的研究进展很快，本文仅就分子标记在果树研究中的应用及存在问题做一介绍，并对应用前景做一展望。

一、分子标记在果树研究中的应用：

1.分子标记在种质资源研究中的应用。

（1）系谱分析和分类。物种在进化过程中，其DNA是一个渐变的过程。遗传关系越近，基因组DNA的差异越小，反之，差异越大。HARADA T等用RAPD标记对两个三倍体苹果品种“乔纳金”和“陆奥”进行了分析，结果表明，作为母本的金冠提供了减数的二倍体配子。沈向等对杏进行了RAPD分析，将41个品种分为5类。

（2）种质保存和核心种质的建立。如何事理有效地管理和利用种质资源，当今世界出现了两种趋势，其中之一就是建立核心种质。目的是以最少的种质样品重复而最大地包含一个种及其野生种的遗传多样性。分子标记为人们提供了一个有效、快速的途径。目前已建立的核心种质涉及到谷物、豆类、牧草、蔬菜和果树等。AMY K SZEWC-MCFADDEN等用SSR结合园艺性状建立了苹果的核心种质，HOKANSON等也建立了苹果核心种质。

（3）构建指纹图谱和品种鉴别。高质量的指纹图谱可作为新品种登记、注册和产权保护的重要依据。特别是对于无性繁殖的果树来说，同物异名、同名异物现象很严重，利用分子标忘本中高效、准确地建立指纹图谱、鉴别果树品种。张潞生利用AFLPs建立了清晰的狒猴桃的指纹图谱，宋婉建立了枣优良品种的DNA指纹图谱。祝军对苹果进行了AFLP分析，得到了苹果的DNA指纹图谱，刘孟军对枣和酸枣进行了FRAPD分析，将亲缘关系极近的金丝小枣和无核小枣区分开。

（4）体细胞杂种和外源基因渗入的鉴定。利用分子标记可在试管苗期快速、准确地对体细胞杂种进行鉴定。史永忠对柑橘进行了体细胞杂种鉴定，认为体细胞杂种表现为双亲谱带之和。另外，珠心胚现象使柑橘合子苗与珠心苗在苗期很难鉴别，严重阴碍柑橘的杂交育种，LURO对柠檬的实生后代RAPD分析指出，杂交合子苗由于有外源基因的渗入，谱带比珠心苗多。

2.构建分子遗传图谱。

在人类基因组计划的推动下，新西兰和欧洲的两个“苹果基因组”计划已经启动，同时美国、欧洲也启动了李属植物的基因组作图工程。目前已经建立或初步建立了基因组图谱（险人类基因组图谱为物理图谱外，最近中科院基因研究中心构建了高分辨率的水稻基因组物理图谱，其它绝大多数为遗传连锁图谱）的果树有苹果、桃、樱桃、扁桃、核桃、草莓、葡萄、柑橘、香蕉等十几种。

建立遗传连锁图谱，首先要有一个作图群体。作图的群体主要有F2、F3、BC等。除此之外，单倍体也可应用于果树基因组作图。“单模标本”策略最初来源于对人的精子的研究，后来用于对针叶松(用大配子群体)和斑马鱼的胚胎研究上。STOCKINGER等以孢子来源的愈伤培养群体为试材，做了甜樱桃的遗传连锁图谱。他认为，以单倍体为试材，大多数随机引物扩增中不能标记的杂和位点不会发生，可以促进连锁图谱的建立。陈洪、李平等利用双单倍体(DH)进行水稻基因组作图，指出：F2代或BC1群体，不能通过种子传代维持，所以难以进一步发展已建成的图谱，而DH株系为一个永久性的作图群体，而且RAPD特别适于DH群体作图。

HEMMAT M等针对苹果和其他异型杂交的物种，因无性繁殖而且种内杂交受抑以至于很难有可利用的自交或回交群体用于作图这一事实，提出了“双假测交”(Double pseudotestcross)的构想。“双假测交”设想最初应用于同工酶上，HEMMAT将之扩展至RFLP和RAPD技术，利用苹果“Rome Beauty”与“White Angel”杂交，获得F1代，为父、母本分别作图，获得两张遗传连锁图谱。PATRICK J C等利用“双假测交”的构想做了三张连锁图谱，其中“Wijcik Mclntosh”的图谱包括238标记，分布于19个连锁群，覆盖基因组1206 cM；“NY75441—67”的图谱有110个标记，分布于16个连锁群，“NY 75441—58”的图谱有183个标记，分布于18个连锁群。主要为RAPD标记，另外还有6个同工酶标记，4个形态学标记(Rf：果皮颜色；Vf：黑星病；Co：柱状生长习性；Ma：苹果酸)，标记之间的平均距离为5．0cM。

作图群体确定后，采用分子标记对作图群体进行分析。对于获得的标记进行“适合性测验”，不符合孟德尔遗传的标记不能用于作图。刘孟军以苹果为试材研究了种间杂交一代的分离方式，结果表明有8．0％的标记偏离孟德尔分离比例，1．5％的标记属异常分离(双亲有而后代没有的标记或隔代遗传的标记)。类似的结果在桃、核桃上也有报道，这种分离异常的原因可能与受粉、受精异常有关，另一解释是群体太小或取样有误差。所以作图群体一般为50～200个。

“双假测交”构想中，对于父本表现为杂合而对母本表现为纯合隐性的标记用于父本作图，对于母本表现为杂合而对父本表现为纯合隐性的标记用于母本作图。对于父、母本均表现为杂合的标记可用以确定双亲连锁图中的同源连锁群。对于以共显性RFLP和等位酶为作图手段时，符合1∶2∶1和1∶1分离比例的标记用于作图以RAPD为作图手段时，符合3∶1和1∶1分离比例的标记用于作图。用RAPD技术以单倍体群体为作图群体时，符合1∶1或1∶2或2∶1的分离比例，标记用于作图。因为较高比值的标记可能是由于分离异常或非连锁片段的共迁移而形成的，所以不作为可遗传的标记，对于只在一亲本中为杂合而在另一亲本为纯合的位点，其F1代按1∶1分离，此时RAPD能提供与共显性标记RFLP一样的信息量。采用的标记种类对作图有一定影响，POWELL等提出了MI(Marker index)值的概念，指每个反应的多态性产物的数量。即MI值越大，多态性越好。就MI值而言，几种分子标记按MI值由大到小依次为AFLPs、SSRs、RAPDs、RFLPs。故此可利用几种分子标记结合起来用于建立高密度的连锁图谱。

3．基因连锁标记的寻找与基因**。

基因**是获得有利基因的重要条件，对于大多数果树来说，目前还不能进行准确的基因**，所以当务之急是寻找与基因连锁紧密的分子标记。标记目标性状基因，可以用的群体主要有两种：一是利用近等基因系(NIL，near-isogenic line)，二是利用分离群体分组分析(BSA，Bulk segregant analysis)。近等基因系是指只有目标性状基因有差异，其它性状基因相同的两个群体。近等基因系是通过不平衡杂交获得的。所以在果树上是很难获得的。目前果树上主要是利用BSA法，BSA法的具体做法是：将分离群体中研究的目标性状根据其类型(如抗病、感病)分成两组，将每组内一定数量的植株DNA等量混合，形成两个池，这两个池除在目标性状(抗病性)上有差异外，其余遗传背景均相同。利用分子标记技术寻找两个池的扩增谱带的差异，这种多态性极可能与目标基因连锁。再用所有的分离后代单株，验证该多态性是否真正与目标基因连锁及连锁距离的确定。如果分离群体不易获得，可采取混合样品法。以抗病性为例，即尽可能地把所有的抗病品种的DNA等量混合，作为一个基因池；把所有的感病品种的DNA等量混合，作为一个基因池，对两个基因池的DNA多态性进行分析，但是这种方法不能进行遗传距离的计算，彭建营利用混合样品法找出了一个可能与枣无核性状相关的DNA片段。另外，果树上很多性状为数量性状，对于控制数量性状的QTLs(Quan-titative trait loci)的寻找，分子标记提供了非常方便快捷的方法。NANDIS等人利用AFLP和选择基因型(Se-lective genotyping)，为控制水稻抗涝的QTLs**。并指出选择基因型对于QTLs的**提供了一条快速容易的途径。选择基因型指在RIL群体中，选择目标性状是两极(如特抗涝、对涝极敏感)的个体来进行DNA多态性分析。除了选择基因型外，间隔作图(Interval mapping)，后代测定和同时搜寻(Progeny testing and simul-taneous search)，均有利于提高QTLs作图的准确度和效率。另外，还可以利用已有的连锁图进行标记，一旦发现某一目标基因被**在某一染色体上，就可以选择分散在染色体不同位点上的标记，进行染色体滑步(Chromosomewalking)，直至找到目标基因。

日前，已在各种果树上找到了与主要性状基因连锁的标记。

4.MAS(Marker-assisted selection)。MAS是分子标记在育种上的一个重要应用。当与目标基因相连锁的分子标记和 目标基因相距5cM之内时，即可用于MAS。目前果树上可用做MAS的标记不是很多。MAS可以跟踪、检测外源基因、进行全基因组选择，辅助选择同效基因的累加，尤其是在抗病性选择上，MAS提供了一个准确、快速的方法。利用与抗病基因紧密连锁的分子标记，可在无病侵染条件下，进行早期抗病性鉴定，无须后代测定即可进行重叠抗性基因的组建。有关MAS的效率有人作过研究，指出：用与互斥相(Kepulsion-phase)连锁的标记可提高MAS的效率。另外以纯合互斥相和互引相的RAPD标记的表现型为基础的个体选择与以共显性的标记(RFLPs)为基础的选择、仅用互斥相标记的选择是相似的。再有，当用于重组近交系上时，以连锁的RAPD标记为基础的MAS与以RFLP标记为基础的MAS的效率相似，因为重组近交系的杂合水平最小。

虽然MAS在理论上对植物改良有益，但在实践上还未见成功报道。限制应用的因素主要有以下几个方面：①连锁群中探测到的与目标性状紧密连锁的分子标记位点的数目；②探测低遗传率的数量性状所需群体的大小；③由确定多个分子标记位点的权重而带来的取样误差；④表型信息和获得每单位信息量的费用。

5.杂种优势预测。

杂种优势来源于亲本有利基因的杂合性。由于在某种程度上，两亲本品系具有与杂种优势有关的DNA区域纯合度较高，其F1代杂种优势就可能越大。所以可以根据各品系在这些可能与杂种优势有关的DNA区域上的多态性，构建杂种优势群，指导杂交组合的选配和杂种优势的分析和预测。ZHANG等用RFLP和SSR标记对水稻的杂种优势作了双列分析，在果树上尚未见有这方面的报道。除以上用途外，分子标记还可用于基因的克隆，即根据重要农艺性状的标记及基因组图谱，采用染色体滑步法(Chromosome walking)等手段克隆基因。目前，果树上已克隆的基因至少有苹果、猕猴桃的ACC氧化酶基因，蓝莓的抗旱抗低温蛋白基因，葡萄的控制果实颜色的基因。苹果抗性基因的克隆研究较多，一旦抗性基因被克隆，这些基因就可能转到其他的品质优良但抗性差的品种中去，这对苹果的抗性育种无疑将是一次革命。

二、存在问题及前景展望：

果树研究的一个主要目标就是培育优质抗病的优良品种，对于多年生果树来说，由于其高度杂合、自交不亲和、育种周期长等特点，传统的育种方法盲目性很大。获得控制主要经济性状的基因，进而能调控这些基因的表达，成为几代果树育种工作者的梦想。而分子标记的应用给果树育种注入了新的活力。在苹果基因组计划和李属植物基因组计划的有力推动下，一系列的分子连锁图谱已经建成。高密度的分子连锁图谱对于基因**、基因克隆及MAS意义重大。然而同其它农作物相比，果树的遗传连锁图谱饱和度及可用于MAS的标记数目还有待于增加。

以基因组作图为中心的基因组学发展很快。近几年又出现了一门新的学科——比较基因组学(Compar-ative mapping)。经研究证明：禾谷类物种之间基因组较保守，染色体上的基因顺序和含量有一定相似性，比较基因组学正是基于这样一种事实而发展起来的。比较基因组学为进化研究、饱和遗传图谱的建立、直向同源基因(Orthologus genes)基于图谱的克隆提供了有力手段，一旦某同源基因被克隆和测序，信息可很快用于其它植物上同源基因的克隆。随着不同实验室李属植物遗传连锁图谱的初步建立，作图的下一步要涉及到各图谱的比较和统一，目的在于产生该物种的较为完整的图谱。目前以桃的基因组克隆做探针在欧洲酸樱桃上研究表明：50％的桃的基因组克隆导致了欧洲酸樱桃RFLPs的产生，另外，桃第三个连锁群上紧密连锁的两个RFLP标记B4A9和B7A5在欧洲酸樱桃上也紧密连锁。以上研究结果无疑对李属乃至整个果树比较基因组的研究提供了良好的开端。

随着分子标记手段的不断更新和基因组图谱的日趋饱和，其应用也随之向深度和广度推进，分子生物学又出现了“功能基因组学”(Function genomics)和后基因组学(Post genomics)，主要是研究基因结构、表达和调控。随之而产生的DNA芯片技术(DNA chip)和信使RNA差异显示技术(Messenger RNA differentialdisplay，mRNA DD)为基因的**、表达研究提供了崭新工具，相信在人类基因组计划的强大推动下，在水稻、小麦等农作物基因组研究的影响下，分子标记在果树的应用研究必将迎来一个迅速发展的时代。